Journal of Rafsanjan University of Medical Sciences
مجله دانشگاه علوم پزشکی رفسنجان
JRUMS
Medical Sciences
http://journal.rums.ac.ir
69
journal69
1735-3165
2008-7268
10.61186/jrums
fa
jalali
1400
4
1
gregorian
2021
7
1
20
4
online
1
fulltext
fa
ارتباط چندشکلی rs6543115 در پروموتر ژن IL1RL1 با افزایش خطر ابتلاء به سرطان کولون: یک مطالعه توصیفی
Association of rs6543115 Single Nucleotide Polymorphism in the IL1RL1 Gene Promoter with Increased Risk of Colon Cancer: A Descriptive Study
علوم آزمايشگاهي
علوم آزمايشگاهي
پژوهشي
Research
<strong><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;">چکیده</span></span></strong><br>
<strong><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;">زمینه و هدف:</span></span></strong><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;"> یکی از ژن­هایی که در سرطان کولورکتال نقش آن مشخص شده است، </span></span><span dir="LTR">IL1RL1</span><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;"> (</span></span><span dir="LTR">Interleukin 1 recptor like 1</span><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;">) می­باشد. این ژن کدکننده یک گیرنده برای اینترلوکین-33 می­باشد که همراه با لیگاند خود در سرطان کولورکتال نقش دارد. چندشکلی­های تک نوکلئوتیدی متعددی در تنظیم بیان این ژن نقش دارند که در این مطالعه ارتباط ژنوتیپ­های چندشکلی </span></span><span dir="LTR">rs6543115</span><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;"> در پروموتر ژن </span></span><span dir="LTR">IL1RL1</span><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;"> با سرطان کولون مورد بررسی قرار گرفته است.</span></span><br>
<strong><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;">مواد و روش­ها:</span></span></strong><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;"> در این پژوهش توصیفی، </span></span><span dir="LTR">DNA</span><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;"> ژنومیاز نمونه خون 100 بیمار مبتلا به سرطان کولون و 100 فرد سالم استخراج گردید و ناحیه دربرگیرنده چندشکلی مورد نظر با استفاده از پرایمرهای مناسب و با تکنیک </span></span><span dir="LTR">PCR</span><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;">، ابتدا تکثیر و سپس توالی­یابی شد و همه نمونه­ها تعیین ژنوتیپ شدند. در نهایت، با استفاده از آزمون­های آماری مجذور کای و رگرسیون لجستیک ارتباط ژنوتیپ­های </span></span><span dir="LTR">rs6543115</span><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;"> در ژن </span></span><span dir="LTR">IL1RL1</span><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;"> با سرطان کولون بررسی شد.</span></span><br>
<strong><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;">یافته­ها:</span></span></strong><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;"> نتایج نشان داد که</span></span> <span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;">ژنوتیپ </span></span><span dir="LTR">GC</span><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;"> (273/0=</span></span><span dir="LTR">OR</span><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;">، 827/0</span></span> <span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;">-</span></span> <span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;">090/0: فاصله اطمینان 95%، 022/0=</span></span><span dir="LTR">P</span><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;">) و </span></span><span dir="LTR">CC</span><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;"> (086/0=</span></span><span dir="LTR">OR</span><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;">، 232/0</span></span> <span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;">-</span></span> <span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;">032/0</span></span> <span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;">:فاصله اطمینان 95%، 001/0></span></span><span dir="LTR">P</span><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;">) به عنوان یک فاکتور خطر در مقایسه با ژنوتیپ </span></span><span dir="LTR">GG</span><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;">، استعداد ابتلاء به سرطان کولون را به طور معنی­داری کاهش می­دهد. هم­چنین نتایج نشان داد که آلل </span></span><span dir="LTR">C</span><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;"> نیز در مقایسه با آلل </span></span><span dir="LTR">G</span><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;">، استعداد ابتلاء به سرطان کولون را به طور معنی­داری کاهش می­دهد (119/0=</span></span><span dir="LTR">OR</span><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;">، 232/0</span></span> <span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;">-</span></span> <span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;">066/0</span></span> <span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;">:فاصله اطمینان 95%، 001/0></span></span><span dir="LTR">P</span><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;">). </span></span><br>
<strong><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;">نتیجه­گیری:</span></span></strong><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;"> به نظر می­رسد چند شکلی </span></span><span dir="LTR">rs6543115</span><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;"> در ژن </span></span><span dir="LTR">IL1RL1</span><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;"> با خطر ابتلاء به سرطان کولون ارتباط دارد.</span></span><br>
<strong><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;">واژه­های کلیدی:</span></span></strong><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;"> سرطان کولون، ژن </span></span><span dir="LTR">IL1RL1</span><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;">، چندشکلی </span></span><span dir="LTR">rs6543115</span><span dir="LTR"><span style="font-size:1.0pt;"></span></span>
<div dir="rtl" style="text-align: left;"><strong>Background and Objectives: </strong>One of the genes that has been proven to play a role in colorectal cancer is IL1RL1 (Interleukin 1 receptor like 1). This gene encodes a receptor for interleukin 33 that has been shown with its ligand, to be involved in colorectal cancer. Several single nucleotide polymorphisms are involved in regulating the expression of IL1RL1 gene, so that this study investigated the association between genotypes of rs6543115 polymorphism in the promoter of IL1RL1 gene and colon cancer.<br>
<strong>Materials and Methods:</strong> In this descriptive study, genomic DNA was extracted from blood samples of 100 patients with colon cancer and 100 healthy individuals. The region containing the desired polymorphic site was amplified using appropriate primers and PCR technique, and then was sequenced, and all samples were genotyped. Finally, logistic regression analysis and chi-square test were used to assess the association between rs6543115 genotypes in IL1RL1 gene and colon cancer.<br>
<strong>Results:</strong> The results showed that genotype GC (OR= 0.273, 95%CI: 0.090-0.827, p= 0.022) and CC (OR= 0.086, 95%CI: 0.032-0.232, p<0.001) as a risk factor in comparison to genotype GG, significantly decreased the susceptibility of colon cancer. Also, the results showed that the allele C, in comparison to allele G, significantly reduced the risk of colon cancer (OR= 0.119, 95%CI: 0.066-0.232, p< 0.001).<br>
<strong>Conclusion:</strong> The rs6543115 polymorphism in the IL1RL1 gene appears to be associated with the risk of colon cancer.<strong><span dir="RTL"></span></strong><br>
<strong>Key words:</strong> Colon cancer, IL1RL1 gene, rs6543115 polymorphism<br>
<br>
<strong>Funding:</strong> This study was funded by Islamic Azad University, Kazerun Branch.<br>
<strong>Conflict of interest: </strong>None declared<br>
<strong>Ethical approval: </strong>The Ethics Committee of the Islamic Azad University, Kazerun Branch, approved the study (IR.IAU.KAU.REC.1398.013).<strong><span dir="RTL"></span></strong><br>
<br>
<strong>How to cite this article: </strong>Dehbozorgi T, Moghanibashi M, Mohamadynejad P. Association of rs6543115 Single Nucleotide Polymorphism in the IL1RL1 Gene Promoter with Increased Risk of Colon Cancer: A Descriptive Study. <em>J Rafsanjan</em> <em>Univ Med Sci</em> 2021; 20 (4): 405-14. [Farsi]</div>
سرطان کولون, ژن IL1RL1, چندشکلی rs6543115
Colon cancer, IL1RL1 gene, rs6543115 polymorphism
405
414
http://journal.rums.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-5063-1&slc_lang=fa&sid=1
T.
Dehbozorgi
طیبه
ده بزرگی
lona.dbz@gmail.com
6900319475328460045728
6900319475328460045728
No
دانشگاه آزاد اسلامی وامد کازرون
M.
Moghanibashi
مهدی
مغنی باشی
mehdimoghani@yahoo.com
6900319475328460045729
6900319475328460045729
Yes
دانشکده پزشکی واحد کازرون
P.
Mohamadynejad
پریسا
محمدی نژاد
parisa_mohamadynejad@yahoo.com
6900319475328460045730
6900319475328460045730
No
دانشگاه آزاد شهرکرد