جلد 18، شماره 2 - ( 2-1398 )
جلد 18 شماره 2 صفحات 192-177 |
برگشت به فهرست نسخه ها
Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
Shakeran Z, Shakeran Z, Nosrati M. Bioinformatics Study of the Effects of Some Phytocompounds Found in Ferulago Angulat, Scrophularia Striata and Laurus Nobilis Medicinal Plants on Inhibition of the Proteins Causing Antibiotic Resistance in Staphylococcus Aureus: A Descriptive Study. JRUMS 2019; 18 (2) :177-192
URL: http://journal.rums.ac.ir/article-1-4349-fa.html
URL: http://journal.rums.ac.ir/article-1-4349-fa.html
شاکران زینب، شاکران زهرا، نصرتی مختار. بررسی بیوانفورماتیکی تأثیر ترکیبات گیاهی موجود در گیاهان دارویی Ferulago angulat، Scrophularia striata و Laurus nobilis در مهار پروتئینهای مؤثر در بروز مقاومت آنتیبیوتیکی در استافیلوکوکوس اورئوس: یک مطالعه توصیفی. مجله دانشگاه علوم پزشکی رفسنجان. 1398; 18 (2) :177-192
گروه بیوتکنولوژی، دانشکده علوم و فناوری‌های نوین، دانشگاه اصفهان
چکیده: (3506 مشاهده)
چکیده
زمینه و هدف: اخیراً عفونتهای ناشی از استافیلوکوکوس اورئوس (Staphylococcus aureus; S. aureus) و ایجاد جدایه‌های مقاوم به آنتی بیوتیکها افزایش یافته است. بنابراین مطالعات فراوانی به منظور معرفی ترکیبات جدید با فعالیت ضد S. aureus بهویژه ترکیباتی با منشاء طبیعی جهت مقابله با گونههای مقاوم به آنتی بیوتیک انجام گرفته است. هدف از این مطالعه تعیین غربالگری بیوانفورماتیکی مهارکنندههای نوین پروتئینهای مرتبط با بروز مقاومت آنتیبیوتیکی موجود در گیاهان دارویی بود.
مواد و روشها: در این مطالعه توصیفی، ابتدا ساختار سه بعدی ترکیبات فیتوشیمیایی موجود در سه گیاه دارویی Ferulago angulat، Scrophularia striata و Laurus nobilis از پایگاه داده PubChem دریافت شد. سپس ساختار سه بعدی چهار پروتئین مرتبط با بروز مقاومت آنتیبیوتیکی شامل β-lactamase، پروتئین متصل شونده به پنی‌سیلین a2 (a2PBP)، ونکومایسین A (VanA) و D-آلانیل D-آلانین دی پپتیداز (VanX) به کمک پایگاه دادههای پروتئین به دست آمد. در نهایت، توانایی ترکیبات شیمیایی انتخاب شده جهت مهار پروتئینهای مرتبط با مقاومت آنتیبیوتیکی مذکور با استفاده از روش داکینگ مولکولی بهوسیله نرم‌افزار 1. 2iGemdock بررسی شد.
یافته‌ها: نتایج نشان داد که اکثر ترکیبات مورد بررسی، برهمکنشهای مناسبی با تمامی پروتئینهای مورد مطالعه به ویژهVanX دارند. نتایج همچنین نشان داد که دو ترکیب Phthalate (ethylhexyl-2)Bis و Palmitic acid قویترین برهمکنشها را با تمامی پروتئینهای مورد بررسی دارند.
نتیجهگیری: نتایج این مطالعه نشان داد که که دو ترکیب Phthalate (ethylhexyl-2)Bis و Palmitic acid موجود در گیاهان دارویی بررسی شده کاندیدهای مناسبی برای مطالعات برون تنی و درون تنی مرتبط با فعالیت ضد S .aureus مقاوم به آنتیبیوتیک میباشند.
واژههای کلیدی: استافیلوکوکوس اورئوس، مقاومت آنتیبیوتیکی، گیاهان دارویی، بیوانفورماتیک
زمینه و هدف: اخیراً عفونتهای ناشی از استافیلوکوکوس اورئوس (Staphylococcus aureus; S. aureus) و ایجاد جدایه‌های مقاوم به آنتی بیوتیکها افزایش یافته است. بنابراین مطالعات فراوانی به منظور معرفی ترکیبات جدید با فعالیت ضد S. aureus بهویژه ترکیباتی با منشاء طبیعی جهت مقابله با گونههای مقاوم به آنتی بیوتیک انجام گرفته است. هدف از این مطالعه تعیین غربالگری بیوانفورماتیکی مهارکنندههای نوین پروتئینهای مرتبط با بروز مقاومت آنتیبیوتیکی موجود در گیاهان دارویی بود.
مواد و روشها: در این مطالعه توصیفی، ابتدا ساختار سه بعدی ترکیبات فیتوشیمیایی موجود در سه گیاه دارویی Ferulago angulat، Scrophularia striata و Laurus nobilis از پایگاه داده PubChem دریافت شد. سپس ساختار سه بعدی چهار پروتئین مرتبط با بروز مقاومت آنتیبیوتیکی شامل β-lactamase، پروتئین متصل شونده به پنی‌سیلین a2 (a2PBP)، ونکومایسین A (VanA) و D-آلانیل D-آلانین دی پپتیداز (VanX) به کمک پایگاه دادههای پروتئین به دست آمد. در نهایت، توانایی ترکیبات شیمیایی انتخاب شده جهت مهار پروتئینهای مرتبط با مقاومت آنتیبیوتیکی مذکور با استفاده از روش داکینگ مولکولی بهوسیله نرم‌افزار 1. 2iGemdock بررسی شد.
یافته‌ها: نتایج نشان داد که اکثر ترکیبات مورد بررسی، برهمکنشهای مناسبی با تمامی پروتئینهای مورد مطالعه به ویژهVanX دارند. نتایج همچنین نشان داد که دو ترکیب Phthalate (ethylhexyl-2)Bis و Palmitic acid قویترین برهمکنشها را با تمامی پروتئینهای مورد بررسی دارند.
نتیجهگیری: نتایج این مطالعه نشان داد که که دو ترکیب Phthalate (ethylhexyl-2)Bis و Palmitic acid موجود در گیاهان دارویی بررسی شده کاندیدهای مناسبی برای مطالعات برون تنی و درون تنی مرتبط با فعالیت ضد S .aureus مقاوم به آنتیبیوتیک میباشند.
واژههای کلیدی: استافیلوکوکوس اورئوس، مقاومت آنتیبیوتیکی، گیاهان دارویی، بیوانفورماتیک
نوع مطالعه: پژوهشي |
موضوع مقاله:
زيست شناسي
دریافت: 1397/4/7 | پذیرش: 1397/10/12 | انتشار: 1398/2/25
دریافت: 1397/4/7 | پذیرش: 1397/10/12 | انتشار: 1398/2/25
ارسال پیام به نویسنده مسئول
| بازنشر اطلاعات | |
 |
این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است. |
